Kit DNA TIANamp FFPE

Purificazione ad alta efficienza del DNA da tessuti fissati in formalina e inclusi in paraffina mediante trattamento con xilene.

TIANamp FFPE DNA Kit è ottimizzato per la purificazione del DNA da sezioni di tessuto FFPE. Utilizza lo xilene per rimuovere la paraffina e fornisce condizioni di lisi uniche per il rilascio del DNA dalla fetta di tessuto. In combinazione con una membrana a base di silice a legame selettivo e un sistema di eluizione flessibile, questo kit potrebbe eluire DNA di alta qualità in un piccolo volume. Il DNA purificato può servire direttamente come modelli per il rilevamento a valle o altre applicazioni.

Gatto. No Dimensione dell'imballaggio
4992524 50 preparazioni

Dettagli del prodotto

Esempio sperimentale

FAQ

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Caratteristiche

■ Elevata purezza: la membrana in silice elimina la maggior parte delle impurità.
■ Ampio utilizzo: adatto per sezioni in paraffina, blocchi di paraffina e campioni inclusi in formalina.
■ Operazione rapida: il DNA può essere ottenuto entro 1 ora.

Specifiche

Tipo: Spin colonna basata
Campione: sezione in paraffina, blocco di paraffina e campioni inclusi in formalina
Obiettivo: DNA genomico
Volume iniziale: 5-8 pezzi di sezioni in paraffina o 30 mg di tessuto in paraffina o formalina
Tempo di funzionamento: ~ 1 ora
Applicazioni a valle: PCR, analisi del genotipo SNP, analisi STR, analisi farmacogenomica, costruzione di librerie NGS, ecc.

Tutti i prodotti possono essere personalizzati per ODM/OEM. Per dettagli,fare clic su Servizio personalizzato (ODM/OEM)


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    Il DNA genomico estratto dal kit TIANamp FFPE DNA e il relativo prodotto dal fornitore A sono stati amplificati a frammenti di 190 bp, 330 bp, 500 bp, 650 bp e 1300 bp. Il risultato mostra che il DNA estratto dal kit TIANamp FFPE DNA ha una resa più elevata, una purezza più elevata soprattutto per i frammenti di grandi dimensioni.

    Experimental Example

    Materiale di partenza: campioni FFPE di fegato di topo (5 pezzi, 10 μm/pezzo)
    Procedura: seguire le istruzioni di ciascun prodotto.
    Caricamento del gel: il gDNA è stato eluito con 50 μl di tampone di eluizione ed è stato amplificato a 190 bp, 330 bp 500 bp, 650 bp e 1300 bp. 5 μl di 20 μl di prodotti PCR sono stati caricati per corsia su gel di agarosio all'1%. L'elettroforesi è stata condotta a 6 V/cm per 20 min.
    M: Marcatore TIANGEN D2000;
    T: kit DNA TIANamp FFPE;
    A: Prodotto rilevante dal fornitore A.

     

    D: Poco o nessun DNA nell'eluente.

    A-1 Bassa concentrazione di cellule o virus nel campione di partenza —Arricchire la concentrazione di cellule o virus.

    A-2 Lisi dei campioni insufficiente —I campioni non sono stati miscelati accuratamente con il tampone di lisi. Si consiglia di miscelare accuratamente con vortex a impulsi per 1-2 volte. —Lisi cellulare insufficiente causata dalla diminuzione dell'attività della proteinasi K. —Lisi cellulare o degradazione delle proteine ​​insufficiente a causa del tempo insufficiente del bagno caldo. Si consiglia di tagliare il tessuto in piccoli pezzi e prolungare il tempo del bagno per rimuovere tutti i residui nel lisato.

    A-3 Adsorbimento di DNA insufficiente. —Nessun etanolo o una bassa percentuale invece del 100% di etanolo è stato aggiunto prima che il lisato fosse trasferito alla colonna spin.

    A-4 Il valore del pH del tampone di eluizione è troppo basso. —Regolare il pH tra 8,0-8,3.

    D: Il DNA non si comporta bene negli esperimenti di reazione enzimatica a valle.

    Etanolo residuo nell'eluente.

    —Vi è residuo di tampone di lavaggio PW nell'eluente. L'etanolo può essere rimosso centrifugando la colonna spin per 3-5 min, e poi ponendola a temperatura ambiente o in un incubatore a 50 per 1-2 min.

    D: degradazione del DNA

    A-1 Il campione non è fresco. —Estrarre un campione di DNA positivo come controllo per determinare se il DNA nel campione si è degradato.

    A-2 Pretrattamento improprio. —Causa da un'eccessiva macinazione dell'azoto liquido, dalla ripresa di umidità o da una quantità eccessiva di campione.

    D: Come eseguire il pretrattamento per l'estrazione del gDNA?

    I pretrattamenti dovrebbero variare per i diversi campioni. Per i campioni di piante, assicurati di macinare accuratamente in azoto liquido. Per i campioni animali, omogeneizzare o macinare accuratamente in azoto liquido. Per campioni con pareti cellulari difficili da rompere, come batteri G+ e lieviti, si consiglia di utilizzare lisozima, liticasi o metodi meccanici per rompere le pareti cellulari.

    D: Qual è la differenza tra i tre kit di estrazione del gDNA vegetale 4992201/4992202, 4992724/4992725, 4992709/4992710?

    4992201/4992202 Plant Genomic DNA Kit adotta un metodo basato su colonne che richiede cloroformio per l'estrazione. È particolarmente adatto per vari campioni di piante, nonché per la polvere secca di piante. Anche Hi-DNAsecure Plant Kit è a base di colonne, ma non necessita di estrazione con fenolo/cloroformio, il che lo rende sicuro e non tossico. È adatto per piante con alto contenuto di polisaccaridi e polifenoli. 4992709/4992710 DNAquick Plant System adotta un metodo a base liquida. Anche l'estrazione di fenolo/cloroformio non è necessaria. La procedura di purificazione è semplice e veloce senza limiti per le quantità iniziali del campione, in modo che gli utenti possano regolare la quantità in modo flessibile in base ai requisiti sperimentali. Grandi dimensioni di frammenti di gDNA possono essere ottenute con un'elevata resa.

    Qual è la resa stimata di gDNA da 1 ml di campione di sangue di TIANamp Blood DNA Kit?

    Il DNA genomico è stato estratto da diversi volumi di campioni di sangue intero umano mediante il kit TIANamp Blood DNA. I risultati sono i seguenti. I risultati sono elencati solo come riferimento, i risultati effettivi dell'estrazione dipendono dalle condizioni dei campioni.

    faq

    D: È possibile utilizzare 4992207/4992208 e 4992722/4992723 per estrarre il DNA dei coaguli di sangue?

    L'estrazione del DNA del coagulo di sangue può essere eseguita utilizzando i reagenti forniti in questi due kit semplicemente modificando il protocollo con le istruzioni specifiche per l'estrazione del DNA del coagulo di sangue. La copia elettronica del protocollo di estrazione del DNA del coagulo di sangue può essere rilasciata su richiesta.

    D: Quando si applica il kit TIANamp Genomic DNA, come rompere i tessuti freschi in sospensione cellulare?

    Sospendere il campione fresco con 1 ml di PBS, soluzione salina normale o tampone TE. Omogeneizzare completamente il campione con un omogeneizzatore e raccogliere il precipitato sul fondo di una provetta mediante centrifugazione. Eliminare il surnatante e risospendere il precipitato con 200 microlitri di tampone GA. La seguente purificazione del DNA può essere eseguita secondo le istruzioni.

    D: Come scegliere il prodotto per l'estrazione del DNA da campioni di plasma, siero e fluidi corporei?

    Per la purificazione del gDNA in campioni di plasma, siero e fluidi corporei, si consiglia il kit TIANamp Micro DNA. Per la purificazione del gDNA del virus da campioni di siero/plasma, si consiglia il kit TIANamp Virus DNA/RNA. Per la purificazione del gDNA batterico da campioni di siero e plasma, si consiglia il kit TIANamp Bacteria DNA (il lisozima deve essere incluso per i batteri positivi). Per i campioni di saliva, sono consigliati il ​​kit Hi-Swab DNA e il kit TIANamp Bacteria DNA.

    D: Come scegliere i kit per l'estrazione del gDNA da campioni di funghi?

    DNAsecure Plant Kit o DNAquick Plant System sono raccomandati per l'estrazione del genoma fungino. Per l'estrazione del genoma del lievito, si consiglia il kit TIANamp Yeast DNA (la liticasi deve essere preparata autonomamente).

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